MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 9613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015562	ATT	3	9	592211	592219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_015562	T	6	6	592218	592223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015562	T	6	6	592248	592253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015562	AAT	2	6	592351	592356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_015562	ATT	2	6	592361	592366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_015562	TGA	2	6	592383	592388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015562	TTTA	2	8	592391	592398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015562	A	6	6	592417	592422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015562	TA	3	6	592462	592467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015562	AAG	2	6	592510	592515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_015562	TA	3	6	592530	592535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015562	T	7	7	592608	592614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015562	AAT	2	6	592616	592621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015562	CAT	2	6	592627	592632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_015562	ATGGAA	2	12	592659	592670	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015562	GAC	2	6	592806	592811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_015562	TTGA	2	8	592851	592858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015562	CTA	2	6	592960	592965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_015562	AT	5	10	593054	593063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_015562	AAT	2	6	593092	593097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015562	ATT	2	6	593130	593135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015562	AT	3	6	593171	593176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015562	AT	3	6	593189	593194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015562	AAT	2	6	593264	593269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015562	TTAAG	2	10	593342	593351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015562	CAA	2	6	593382	593387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_015562	CAA	2	6	593412	593417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_015562	CAA	2	6	593452	593457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015562	CAA	2	6	593482	593487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_015562	ATG	2	6	593520	593525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_015562	TGG	2	6	593593	593598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_015562	ATTTT	2	10	593659	593668	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015562	AGCGA	2	10	593690	593699	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_015562	AGT	2	6	593700	593705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015562	TGA	2	6	593716	593721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3037	NC_015562	GTT	2	6	593819	593824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015562	T	6	6	593831	593836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_015562	CAA	2	6	593852	593857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_015562	ATTT	2	8	593885	593892	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015562	T	6	6	593890	593895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015562	TAA	2	6	593901	593906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_015562	ACTTAT	2	12	593943	593954	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3045	NC_015562	TTA	2	6	594005	594010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3051	NC_015562	CA	3	6	594193	594198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_015562	AAC	2	6	594265	594270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3055	NC_015562	CAA	2	6	595603	595608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_015562	AT	3	6	595636	595641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_015562	TAAA	2	8	596260	596267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015562	TTAA	2	8	596294	596301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015562	TTGC	2	8	596324	596331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_015562	TAA	2	6	596353	596358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015562	AG	3	6	596362	596367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015562	TAT	2	6	596424	596429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015562	AT	3	6	596464	596469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015562	TGG	2	6	596480	596485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015562	ATT	2	6	599853	599858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015562	AG	3	6	599927	599932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015562	ATA	2	6	599962	599967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015562	CAT	2	6	600037	600042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_015562	TA	3	6	600069	600074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015562	GTT	2	6	600075	600080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_015562	ATTGT	2	10	600089	600098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_015562	TTTG	2	8	600104	600111	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015562	GTG	2	6	600208	600213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_015562	T	6	6	600518	600523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_015562	ATA	2	6	601620	601625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_015562	TAA	2	6	601769	601774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_015562	TAT	2	6	602218	602223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_015562	ATT	2	6	602229	602234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015562	TTTCAT	2	12	602235	602246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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3084	NC_015562	A	6	6	602766	602771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015562	ATAA	2	8	602814	602821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015562	CAA	2	6	602824	602829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_015562	ATTAAG	2	12	602842	602853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_015562	TCCC	2	8	603152	603159	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3089	NC_015562	AT	4	8	603187	603194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3101	NC_015562	T	6	6	605293	605298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_015562	ACT	3	9	605324	605332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3104	NC_015562	GAT	2	6	605354	605359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3106	NC_015562	TAAT	2	8	605421	605428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015562	AAC	2	6	605462	605467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_015562	GTT	2	6	605478	605483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015562	TAAT	2	8	605550	605557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015562	TAT	2	6	605578	605583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015562	CAA	2	6	605637	605642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3114	NC_015562	T	6	6	606789	606794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015562	TAAA	2	8	606817	606824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3117	NC_015562	ATTTT	2	10	608944	608953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3119	NC_015562	ATACAA	2	12	608992	609003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3120	NC_015562	ATT	2	6	609005	609010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015562	TAAA	2	8	609027	609034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015562	T	6	6	609057	609062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015562	ATT	2	6	609092	609097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015562	ATT	2	6	609128	609133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015562	TCA	2	6	609134	609139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_015562	ATT	3	9	610090	610098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015562	TAT	2	6	610101	610106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015562	TAA	2	6	610160	610165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015562	ATA	2	6	610190	610195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015562	T	6	6	614422	614427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015562	ATTTT	2	10	614433	614442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015562	ATC	2	6	614475	614480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_015562	TGA	2	6	615374	615379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015562	TA	4	8	615411	615418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_015562	AT	3	6	615444	615449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_015562	ATA	2	6	615511	615516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_015562	A	6	6	615549	615554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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